該局表示，轄內甲公司98年度未分配盈餘申報，列報減除彌補以往年度虧損900餘萬元，因無法提供「實際」彌補虧損之股 東會議事錄或經股東承認之盈餘分配表等具體事證供核，否准減除，除按短漏報未分配盈餘補徵10%營利事業所得稅外，並依所得稅法第110條之2規定處以罰鍰。甲公司不服，主張公司因合併而消滅，無法召開股東會，以往年度虧損數經國稅局核定，應准予減除，循序提起行政救濟，經臺北高等行政法院判決甲公司敗訴。

臺北高等行政法院判決理由指出，所得稅法第66條之9關於未分配盈餘之課稅規定，係指營利事業當年度之盈餘未作分配者，即應就該未分配盈餘加徵10%營利事業所得稅，縱該營利事業合併於另一存續之營利事業，其合併前之權利義務，仍應由合併後存續之營利事業概括承受，且最高行政法院99年度7月份第2 次庭長法官聯席會議決議，明揭所得稅法第66條之9第2項第2款規定所謂「彌補以往年度虧損」，係指營利事業以當年度之未分配盈餘，「實際」彌補以往年度之虧損，乃闡明法規之原意。不論營利事業是否經解散或合併，其當年度之未分配盈餘，仍以「實際」彌補以往年度之虧損，始得列為未分配盈餘之減除項目。